实用指南丨scATAC 基本分析思路介绍
TSSenrichment score: 也是文献中常见的一个细胞识别过滤参数，细胞保持活性需要一定数量基因的表达翻译，而基因转录时就需要开放 TSS 区域，好结合转录因子、DNA 聚合酶等转录起始复合物，一般情况下 TSS 区域的 fragments 能占到细胞全部 fragments 的25%~35%，如上图所示，一般要求有效细胞 barcode 的 TSS 富集得分>4且 barcode 包含 fragments>1000，也可设置更为严格的过滤参数，如 TSS 富集得分 >6 或者 >8。
黎曼猜想推至理论边界99.55%，元代理架构AI：在思考中重塑大脑
当我们惊叹于大语言模型能写诗、会编程时，科学家们正面临一个更棘手的问题:如何让AI像真正的科研工作者一样，去解决那些需要数月甚至数年持续思考、且充满未知的科学难题?
Nat Neurosci: 海马星形胶质细胞存在时间序列,学习记忆提取重现
海马锥体神经元可以形成 place cells 和 time cells：place cells 对特定空间位置选择性放电， time cells 在一个事件后的不同时间点依次活跃，从而让一群神经元把一段时间“铺开”。神经元群体通过有组织的时空活动序列构建经历的内部表征。
首个独立完成科研循环的AI系统问世，顶人类科学家六个月工作量
此前，我们曾报道过这家由前谷歌 CEO Eric Schmidt 支持的非营利组织 Future House 所推出的 AI 科学家 Robin。该系统不仅能够自主完成从假设提出、实验设计到数据分析等关键科研环节，还曾为一个复杂眼疾发现了新的潜在药物，在当时引起了相当广泛的关注。
穿山甲的起源假说｜已灭绝的最大的穿山甲长约2米
但这种重建是不确定的——目前从未发现过明确的剑龙残骸。尽管已发现许多保存完好的标本，但从未发现过真正附着在骨架上的标本。
Science | 单细胞分析人类胸腺发育的细胞图谱
The human thymus is the organ responsible for the maturation of many types of T cells， which are immune cells that protect us from infection. However， it is not well known how these cells develop with a full immune complement that contains the necessary variation to protect us from a variety of pathogens. By performing single-cell RNA sequencing on more than 250，000 cells， Park et al. examined the changes that occur in the thymus over the course of a human life. They found that development occurs in a coordinated manner among immune cells and with their developmental microenvironment. These data allowed for the creation of models of how T cells with different specific immune functions develop in humans.
《科学》（20190405出版）一周论文导读
ISSUE6435《科学》2019年4月5日，第6435期364卷物理学PhysicsQuantuminterfaceofanelectronandanuclearensemble电子与原子核系综的量子界面作者：D.A.Gangloff,G.Éthier-Majcher,C.La