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清华团队利用可解释AI解析细胞类型特异的RNA剪接调控
同一个基因通过不同的RNA剪接方式产生多种RNA转录本和蛋白质，是真核细胞转录组与蛋白组复杂性的主要来源之一，也是基因功能调控的重要方式。RNA剪接受到复杂且动态的调控，与肿瘤、发育异常和神经系统疾病等多种疾病密切相关。
从Bulk转录组中分析单细胞空间异质性
近日，浙江大学科研团队在Nature Communications上发表了题为De novo analysis of bulk RNA-seq data at spatially resolved single-cell resolution的研究论文。
CIBERSORT完全指南——从bulk RNA-seq推断免疫浸润
你做完了DESeq2差异表达分析，发现了几百个差异基因。接下来你想了解：这些基因变化是否反映了免疫微环境的改变？哪些免疫细胞在你的疾病中起关键作用？CIBERSORT就是帮你回答这些问题的工具。
肝癌领域研究取得重大突破 专家：肿瘤治疗已经进入免疫治疗时代
2020年12月23日，国际顶级生物学期刊《Cell》刊发了一项复发肝癌相关的重磅研究成果，复旦大学（中山医院）肝癌研究所樊嘉院士团队与深圳华大生命科学研究院合作，采用单细胞RNA测序技术，从单细胞水平上揭示了早期复发性肝癌的免疫特征和肿瘤免疫逃逸机制。
Nature Methods | TCR测序新范式：TIRTL-seq用“组合统计学”填补Bulk深度与单细胞配对之间的技术鸿沟
引言在人体这座精密复杂的生化工厂中，适应性免疫系统无疑是最为令人着迷的防御机制。而在这一机制中，αβ T细胞扮演着核心指挥官与执行者的角色。它们能否精准识别并消灭入侵的病毒或发生癌变的细胞，完全取决于其表面的T细胞受体（T Cell Receptor, TCR）。