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如何利用AI完成单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析?
过去,我们研究组织,看到的是:所有细胞混合后的平均结果。但是,人体组织并不是由一种细胞组成。肿瘤中有:癌细胞;免疫细胞;成纤维细胞;内皮细胞。那么,我们如何知道:每一种细胞发生了什么变化?答案就是:单细胞RNA测序(scRNA-seq)。
一文搞定ChIP-seq对照&重复设计
一项严谨的科研成果,离不开科学的实验设计,而完善的对照与合理的生物学重复,正是优质ChIP-seq数据的立身之本。本文带您从实验内对照、实验外(样本间)对照、重复规划三方面梳理实验方案,新手照着设计就能大幅降低实验翻车概率。
生信分析服务器怎么配?从 RNA-seq 到单细胞、空间组学与 AI 推理
不是 CPU 核数越多越好,也不是所有生信分析都需要 GPU。真正高效的配置,应当由数据规模、算法瓶颈、并发人数和交付周期共同决定。
如何利用AI完成RNA-seq数据分析?
RNA测序(RNA-seq),已经成为生物医学研究最常用的技术之一。但是,很多科研人员面对RNA-seq数据,第一反应就是:不会写代码。不会R语言,是不是就做不了RNA-seq?答案当然不是。大家好,欢迎来到南博屹生物《AI科研实战系列》。我是Komi博士。
清华团队利用可解释AI解析细胞类型特异的RNA剪接调控
同一个基因通过不同的RNA剪接方式产生多种RNA转录本和蛋白质,是真核细胞转录组与蛋白组复杂性的主要来源之一,也是基因功能调控的重要方式。RNA剪接受到复杂且动态的调控,与肿瘤、发育异常和神经系统疾病等多种疾病密切相关。
中国科大发布开源RNA序列基础模型丨科技前线
近日,中国科学技术大学医学影像智能与机器人(MIRACLE)实验室发布了一款开源RNA(核糖核酸)序列基础模型structRFM,有效提高AI模型在RNA结构预测与功能推断一系列下游任务中的性能,有望助力人工智能驱动的科学研究、生物学机制理解、药物发现等。